Một vài tập đầu tiên sẽ khiến cho những người đã xem bản cũ cảm thấy khó khăn vì đa số đều lặp lại nội dung. Vì lí do đó nên phần đầu của Brotherhood có diễn biến nhanh để có thể tiến đến những nội dung mới và gây sự chú ý cho người xem. Sự khác biệt đơn cử đó là trong bản cũ Homunculi được tạo ra từ quá trình biến đổi con người trong khi đó ở phần Brotherhood thì Homunculi được tạo ra từ một phần của Father. Còn rất nhiều sự thay đổi lớn về nội dung của cả 2 phần nhưng điều mà tôi muốn nói ở đây là việc làm lại series này quả thật là một sự đúng đắn.

Điểm cộng dành cho phần Brotherhood đó chính là việc khắc họa nhân vật rõ nét hơn cũng như là khiến cho thế giới trong Fulletal Alchemist rộng lớn hơn. Khiến cho những nhân vật có nhiều đất diễn và làm cho khán giả trở nên quan tâm tới họ hơn. Một điều chắc chắn là anh em Elric là tâm điểm của mọi thứ, nhưng không có nghĩa là những nhân vật khác chỉ làm nền cho họ, không những thế những nhân vật này đóng vai trò không nhỏ trong trong hệ thống cốt truyện của Brotherhood. Tuy nhiên việc bắt đầu mọi thứ phải từ 2 nhân vật chính này, Edward và Alphonse Elric đã đem đến cho người xem một hành trình cực kì thú vị trong suốt series.

Những cảnh hồi tưởng về quá khứ của 2 anh em khi họ đơn thuần chỉ là những đứa trẻ đang ở cùng với mẹ và người bố Hohenheim. Và rồi mọi thứ tồi tệ đi khi cha của họ bỏ đi và tiếp đó là cái chết của người mẹ. Quá tuyệt vọng trước hiện thực người mẹ đã ra đi, 2 anh em Elric ngày đêm nghiên cứu giả kim thuật với mong muốn hồi sinh người mẹ đã mất. Thế nhưng ngay từ đầu việc hồi sinh người chết đã là một việc bất khả thi. Kết quả của việc cố gắng làm một điều bất khả thi dẫn đến hậu quả vượt xa sự tưởng tượng của 2 anh em, game bai . Edward mất đi cánh tay phải và một phần chân trái còn người em trai Alphonse phải trả giá bằng cả thân thể của mình. Tiếp theo đó là chuyến hành trình phục hồi phần thân thể đã mất của 2 anh em, cùng với đó là việc khám phá ra rất nhiều những bí mật ẩn giấu trong chính quốc gia của mình.